中压紫外线消毒器消灭微生物的原理是利用紫外线辐射破坏微生物的核酸结构，从而阻止其繁殖和生长。具体来说，它通过以下步骤实现微生物的消灭：

1. 紫外线照射： 中压紫外线消毒器产生的紫外线波长通常在200到300纳米之间，属于紫外线-C（UV-C）区域。这种紫外线能量足够高，能够穿透微生物的细胞壁和膜，直接作用于微生物的核酸（DNA和RNA）。

2. 核酸结构破坏： 紫外线-C能量与微生物的DNA和RNA分子发生作用，引发其中的化学键断裂。这会导致微生物的核酸分子内部发生不可修复的损伤，阻止了正常的DNA复制和RNA转录过程。

3. 繁殖受阻： 微生物的DNA和RNA受到损害后，无法在分裂和增殖过程中正确地复制。这使微生物失去了自我繁殖的能力，从而在短时间内导致微生物数量急剧减少。

4. 生物活性受限： 损坏的核酸会阻碍微生物的代谢和生物活性。微生物无法有效地吸收营养和能量，无法正常进行代谢过程，从而使其失去生存和繁殖的能力。

5. 持续效应： 一旦微生物的核酸受到紫外线-C的破坏，它们无法在短时间内修复或恢复活性。然而，需要注意的是，如果新的微生物再次进入水体，它们可能会继续增殖。因此，中压紫外线消毒通常需要与其他水处理方法相结合，以实现持久的消毒效果。

通过这种机制，中压紫外线消毒器能够有效地消灭微生物，包括细菌、病毒、藻类等，从而提高水质，降低疾病传播风险，保护环境和健康。